MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187146	CGC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187146	GT	3	6	67	72	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187146	CGC	2	6	73	78	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187146	CTG	2	6	144	149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187146	ACT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187146	AAG	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187146	CTGT	2	8	258	265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187146	CAGCG	2	10	291	300	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NT_187146	TGG	2	6	362	367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187146	CG	3	6	399	404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187146	AG	3	6	545	550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187146	CTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187146	GGC	2	6	604	609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187146	GAC	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187146	GATT	2	8	2274	2281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187146	TGA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187146	GCG	2	6	2364	2369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187146	CCGA	2	8	5831	5838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NT_187146	TCA	2	6	5859	5864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187146	GC	3	6	5896	5901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187146	ATC	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187146	CTG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187146	GGT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187146	CCG	2	6	6110	6115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187146	GAC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187146	ATG	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187146	CAGCGC	2	12	6166	6177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NT_187146	TCG	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187146	CCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187146	GTCG	2	8	6319	6326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187146	GAA	2	6	6379	6384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187146	GTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187146	GCC	2	6	6443	6448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NT_187146	GCCG	2	8	6544	6551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NT_187146	GCC	2	6	6584	6589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NT_187146	GC	3	6	6607	6612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.